电子缴税的方式包括两种：

一是扣款交易模式。即纳税人与商业银行签订协议，指定扣款账户，纳税金额直接从扣款账户划转的交易过程。包括实时扣款或批量扣款两种业务类型。批量扣款适合双定户，实时扣款适合其它纳税人。

二是主动缴款交易模式（银行端查询缴税）。即指纳税人通过网络、税务柜台等申报形成纳税信息后，在商业银行端通过网上银行、银行柜台、POS机查询申报信息，并主动从银行账户缴款的过程。与扣款交易模式的主要区别在于：纳税人不需要与商业银行签定税款扣缴协议。